Ленинградская экспедиция, преемником которой является «Петербургская комплексная геологическая экспедиция» была создана в 1950 году.

За годы существования экспедиции было проведено множество разнонаправленных исследований. В результате геологоразведочных работ  были открыты, разведаны и подготовлены к разработке такие крупные месторождения  как Ленинградсланец (горючие сланцы), Кингисеппское (фосфориты),  Пикалевское и Угловское (известняки), Малиновецкое и Мишиногорское (вторичные каолины),  Возрождение, Каменногорское, Кузнечное (граниты и гранито-гнейсы) и ряд месторождений огнеупорных глин в Боровичском районе. Эти открытия позволили полностью удовлетворить потребность предприятий территории в общераспространенных полезных ископаемых,  в том числе  для производства новых стройматериалов:  аглопорита, пенощебня, пеностекла и керамзитового гравия.

В 1950-1970 гг. основное внимание было обращено на производство комплексного геолого-гидрогеологического картографирования территории. Тогда же продолжались геологоразведочные работы на открытых ранее крупных месторождениях полезных ископаемых.

В девяностые годы много внимания стало уделяться экологическим исследованиям. Было проведено геоэкологическое картографирование почти всей территории деятельности экспедиции в масштабах 1:500 000-1:1 000 000, завершено комплексное гидрогеологическое и инженерно-геологическое картографирование площади вокруг С.-Петербурга в масштабе 1:50 000, составление комплектов государственных геологических, геоэкологических и гидрогеологических карт нового поколения по отдельным площадям.

Другое направление региональных исследований было связано с развертыванием на Северо-Западе России исследований по выявлению алмазоносности территории. В настоящее время специалисты Экспедиции занимаются подготовкой современных Государственных гидрогеологических карт на территорию региона.

«Петербургская комплексная геологическая экспедиция» активно занимается мониторингом и разведкой подземных вод. Предприятие внесло большой вклад в пополнении ресурсной базы питьевых вод Северо-Западного региона. В 2005 году успешно проведена оценка подземных вод для хозяйственно-питьевого водоснабжения г. Пскова. В 2007 году решена проблема хозяйственно-питьевого водоснабжения города Великий Новгород за счет подземных вод. Кроме того, АО «ПКГЭ» осуществляет ведение государственного мониторинга состояния недр территории Новгородской, Псковской и Вологодской областей.

В составе предприятия постоянно действуют Невская, Вологодская и Псковская партии, а также Тайцкий буровой отряд, работает палеофитологическая лаборатория. Геологическая служба экспедиции включает несколько партий и производственных подразделений. Экспедиция обладает буровым парком и техническими средствами для выполнения всего комплекса геолого-разведочных работ. Камеральные работы ведутся в цифровом виде с применением ГИС-технологий на современных компьютерах, обеспеченных лицензионными программными пакетами последних поколений. 

На внеочередном Общем собрании акционеров (Протокол  № 1/2016 от 28.01.2016 г.) была утверждена новая редакция Устава Общества, согласно которому АО "ПКГЭ" переименовано в АО "Северо-Западное ПГО".